2010年5月29—30日，由《新疆通史》编撰委员会主办、伊犁师范学院协办的“清代新疆历史”学术研讨会在伊犁师范学院隆重召开。出席研讨会的领导有：《新疆通史》编委会主任吴敦夫、副主任王崇久、吴福环、苗普生（专职），中国社会科学院边疆史地研究中心主任厉声，及伊犁哈萨克自治州、伊犁师范学院等单位相关领导。来自疆内外及台湾地区的近70位专家、学者与会，研讨会共提交学术论文32篇。
与会的专家、学者本着百家争鸣、畅所欲言的精神，在“清代新疆历史”这一主题下，着重讨论了“卫拉特蒙古、哈萨克及其与清朝的关系”、“ 清代新疆的政治治理及清末新政”、“屯垦戍边及其历史意义”、“外来侵略与边疆安全”、“人物研究”、“文献资料整理与研究”等诸多方面的问题，取得了丰硕的成果，体现出海内外清代新疆历史研究的新进展。这些研究对于在当前国内外形势急剧变化、新疆经济社会快速发展的新形势下，史学工作者如何在坚持马克思主义的辩证唯物主义和历史唯物主义和收集占有更多的第一手资料的基础上，从更高的视野和更新的视角来研究和撰写清代新疆的历史，使其更好地为新疆经济社会发展及构建社会主义和谐新疆服务提供了有益的借鉴和帮助。整个学术研讨会学术气氛浓厚，讨论热烈。
此外，本次研讨会还组织专家对《新疆通史•清代卷》试写稿进行了集中评议。评审专家对《新疆通史•清代卷》的编写工作给予了充分肯定和高度评价，并对试写稿中存在的问题及改进方法提出了建设性意见。这将有力推进《新疆通史•清代卷》的编写，使其更上一个新的台阶。
最后，苗普生同志从政治、经济、民族关系、文献研究四个方面，对整个研讨会进行了学术总结。吴敦夫同志作总结性发言，指出：《新疆通史》编撰要认真贯彻中央新疆工作座谈会及自治区党委七届九次全委（扩大）会议精神；加强对新疆历史的研究，使之成为“四个认同”有力的学理支撑；青年学者要戒急戒躁，潜心做学问，通过《新疆通史》编撰工作成为真正的人才。
会后，《新疆通史》编委会还组织专家进行了了学术考察。
